 |  |  |  |  |
| | |
||||
| GENE0208-1 | Genomics and bioinformatics | |||||
| ||||||
| Duration : | 25h Th, 15h Pr | |||||
| ||||||
| Credits/ECTS : |
| |||||
| ||||||
| Holder(s) : | Michel Georges, Bernard Joris | |||||
| ||||||
| ||||||
| Course contents : | 1. Génomique a. Génomique structurelle b. Génomique fonctionnelle 2. Bioinformatique: a. Comparaisons de séquences : Une introduction aux différents logiciels permettant de la comparaison entre deux séquences peptidiques ou nucléotidiques sera donnée et comprendra : une description des différentes banques accessibles par le réseau internet, l'utilisation des différents outils informatiques disponibles (SRS, BLAST, FASTA et CLUSTAL), une analyse statistique des résultats obtenus. Des travaux pratiques seront également réalisés. b. Prédiction de gènes et annotation d'une séquence nucléotidique Les différentes méthodes pour identifier une phase codante dans une séquence nucléotidique seront présentées ainsi qu'un logiciel permettant l'annotation d'une séquence nucléotidique issue d'un projet de séquençage d'un génome. De plus, les différents outils permettant la recherche des " signaux " (RBS, terminateurs, recherche d'un pattern, ... ) présents le long d'une chaîne nucléotidique seront également présentés. Les travaux pratiques associés à ce module permettront aux étudiants d'utiliser les logiciels présentés au cours théorique. c. Prédiction d'une fonction à partir d'une séquence A partir d'une séquence peptidique déduite d'une séquence nucléotidique, les différents logiciels permettant de prédire une fonction seront présentés. Ils comprendront : la recherche d'un motif peptidique qui représente la signature d'une famille d'enzyme ou d'une fonction (Criblage des motifs présents dans la banque ProSite), ou la comparaison d'une séquence peptidique avec un séquence consensus déduite à partir d'un alignement multiple (Criblage de la banque Pfam).. d. Analyse statistique des données d'un micro-array Afin d'éviter une interprétation erronée des résultats obtenus lors d'un DNA-array, une méthode statistique sera présentée ainsi que les erreurs à éviter. | |||||
| ||||||
| Assessment : | Les modalités d'examen seront affichées aux valves du Bureau de la Faculté des Sciences dans le courant du 1er semestre. | |||||
| ||||||
| Contacts : | M. Georges - Tél. : 04/366.41.50 - e-mail : Michel.Georges@ulg.ac.be B. Joris - Tél. : 04/366.29.54 - e-mail : bjoris@ulg.ac.be | |||||
| ||||||
ULg : Students and Studies Administration - Academic Affairs
Contact : Monique Marcourt, direction A.E.E.
Date of data : 27/02/2006
Developed by SEGI