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BOTA0401-1

Molecular approaches to the diversity of marine microorganisms


Duration :15h Th, 15h Pr
Credits/ECTS :
2nd year of Master's degree in oceanography, in-depth approach2
Holder(s) :Annick Wilmotte
Course contents : Depuis une quinzaine d'années, il est apparu que l'étude de la diversité des microorganismes marins ne peut se faire sans une approche moléculaire, étant donné que seule une fraction d'entre eux peut être isolée en culture. De plus, pour les microorganismes observables en microscopie, la diversité génétique est plus grande que celle déterminée sur base des caractères phénotypiques. La détermination de la diversité au niveau génétique permet aussi de comprendre des caractéristiques écologiques (distribution géographique, endémisme, ….).
Course objective : Donner aux étudiants les connaissances leur permettant d'une part de comprendre et lire de manière critique la littérature concernant la diversité des microorganismes marins, et d'autre part, d'utiliser les techniques moléculaires pour résoudre les problèmes de diversité et d'écologie sur lesquels ils travaillent.
Prerequisites : Avoir une base de connaissances concernant le matériel génétique, ADN, ARN, protéines. Si ce prérequis est absent, un cours peut être consacré à une mise à niveau.
Workshops : Travail pratique au laboratoire sur un petit problème de diversité de microorganismes marins (souvent cyanobactéries).
Organization : Au 2nd semestre
1) Définitions
2) Pourquoi ?
3) Marqueurs moléculaires de diversité
4) Techniques
5) Construction d'arbres phylogénétiques
6) Transfert latéral de gène
7) Examples d'applications
8) présentation d'un article par les étudiants
Written notes : Il s'agit d'une copie des transparents montrés
Contacts : A. Wilmotte, CIP, Chimie B6, Tél. : 04/366.38.56, e-mail : awilmotte@ulg.ac.be




ULg : Students and Studies Administration - Academic Affairs
Contact : Monique Marcourt, direction A.E.E.
Date of data : 27/02/2006
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