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BACT0001-1

Bactériologie marine


Durée :15h Th, 30h Pr
Crédits/ECTS :
2e année du grade de master en océanographie, à finalité approfondie3
Titulaire(s) :Mathieu Poulicek
Aperçu général : Après avoir brièvement revu les bases de la bactériologie "générale" (structure morphologique et fonctionnement métabolique des bactéries) (3 heures), je décris, selon les données les plus récentes, la biodiversité des microorganismes marins (y-compris la description des techniques)(2 heures). Ensuite, on abordera les spécificités du milieu marin : approches techniques de récolte et de caractérisation des biomasses et des potentiels métaboliques en pleine eau et dans les sédiments, contrôle de la distribution et des activités des bactéries en mer, cycles du carbone, de l'azote, du phosphore et du soufre, description du fonctionnement de la boucle microbienne (8 heures). Le cours se termine par la description de quelques biocénoses bactériennes remarquables essentiellement focalisées sur le phénomène de symbiose : les macroinvertébrés des sources hydrothermales (pogonophores et bivalves) et leur microfaune associée, les bactéries symbiontes de la couche de mucus des coraux et le phénomène de blanchiment (2 heures).
Objectif du cours : Dresser un tableau intégré de l'impact des bactéries dans le fonctionnement océanique.
Pré-requis : Les bases de la microbiologie sont (rapidement) revues au début du cours.
Travaux pratiques : Approches techniques de mesures de la biomasse (épifluorescence UV et dosages d'ATP au compteur de photons), mesures des constantes de croissance et évaluation des activités métaboliques sur des populations bactériennes mixtes (masse filtrante de l'aquarium Dubuisson) (20 heures)
Initiation à l'utilisation de logiciels de calculs et de simulation en microbiologie (10 heures)
Organisation : Cinq fois 3 heures de cours à placer dans l'horaire et 5 journées de TP.
Notes de cours : Syllabus distribué au début du cours
Ouvrage de référence : "Microbial Ecology of the oceans", D.L. Kirchman, Ed. Wiley-Liss Inc.
Evaluation : Examen oral à livre ouvert (deux questions), après préparation.
Contacts : Mathieu Poulicek - Tél 04 366 50 67 - Email: mpoulicek@ulg.ac.be




ULg : Administration de l'Enseignement et des Etudiants - Affaires Académiques
Responsable de l'information : Monique Marcourt, direction A.E.E.
Date de validité des données : 27/02/2006
Réalisation SEGI